صدر قرار انشاء كلية طب الفم و الاسنان بالاسماعيلية عام 1996 م تمشيا مع سياسة الجامعة في نشر العلم و المعرفة و دفع عجلة التقدم في هذه المنطقة الحيوية من ارض الوطن الحبيب و تعتبر كلية طب الاسنان بجامعة قناة السويس من الكليات الحديثة حيث استقبلت أول دفعه من الطلاب في العام الجامعي 1996 /1997م .

وقد بدات الكلية في بناء أقسامها الاكاديمية و العلمية المختلفة و تكوين أعضاء هيئة تدريس و الهيئة المعاونة و الجهاز الأدارى للكلية. ولتحقيق ذلك قامت الكلية بقبول تحويلات أعضاء التدريس من كليات طب الأسنان بالجامعات الأخرى حتى بدات بتعين خريجيها من أول دفعة تخرجت من الكلية عام 2000 /2001م حيث تم تعيين ( 15 ) طالب من خريجي الدفعة الاولي و التي كان اجمالي عدد الخريجين فيها (39 ) طالب وطالبة